Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm25571-201ENSMUST00000178322 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Q3U6N9 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Q3U6N9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Q3U6N9 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q3U6N9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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