Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ttc39dQ0VF76 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ttc39dQ0VF76 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ttc39dQ0VF76 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ttc39dQ0VF76 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
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Ttc39dQ0VF76 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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