Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Cst6-201ENSMUST00000025764 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Dtymk-203ENSMUST00000112893 1040 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 AC108416.3-201ENSMUST00000226148 557 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
TrioQ0KL02 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm9864-201ENSMUST00000090043 1656 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Stard3nl-205ENSMUST00000197565 1391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm11427-201ENSMUST00000117952 1696 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 1010001N08Rik-202ENSMUST00000181316 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TrioQ0KL02 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms