Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmod1P49813 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmod1P49813 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms