Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cdkn1bP46414 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cdkn1bP46414 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms