Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vav1P27870 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vav1P27870 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms