Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prim1P20664 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.8 ms