Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Ranbp1-201ENSMUST00000052325 923 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Irf1P15314 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms