Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gm21976J3QNN2 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gm21976J3QNN2 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gm21976J3QNN2 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gm21976J3QNN2 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Gm21976J3QNN2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21976J3QNN2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Gm21976J3QNN2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21976J3QNN2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms