Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp870J3QMA4 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp870J3QMA4 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp870J3QMA4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp870J3QMA4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp870J3QMA4 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp870J3QMA4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zfp870J3QMA4 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Zfp870J3QMA4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Zfp870J3QMA4 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Zfp870J3QMA4 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms