Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms