Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm3298E9PW80 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm3298E9PW80 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms