Protein–RNA interactions for Protein: E9PVF1

Gm6904, Predicted gene 6904, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6904E9PVF1 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm6904E9PVF1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm6904E9PVF1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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