Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt27Q9Z320 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Krt27Q9Z320 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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