Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lgr5Q9Z1P4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lgr5Q9Z1P4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lgr5Q9Z1P4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms