Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syngr4Q9Z1L2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syngr4Q9Z1L2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms