Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Tmed2Q9R0Q3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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Tmed2Q9R0Q3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Tmed2Q9R0Q3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Tmed2Q9R0Q3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Tmed2Q9R0Q3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Tmed2Q9R0Q3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Tmed2Q9R0Q3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmed2Q9R0Q3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Tmed2Q9R0Q3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Tmed2Q9R0Q3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Tmed2Q9R0Q3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmed2Q9R0Q3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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