Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CtsjQ9R014 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CtsjQ9R014 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms