Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms