Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clcf1Q9QZM3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clcf1Q9QZM3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms