Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Trip4Q9QXN3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trip4Q9QXN3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trip4Q9QXN3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms