Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trpc5Q9QX29 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trpc5Q9QX29 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms