Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc4Q9QUQ5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Trpc4Q9QUQ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Trpc4Q9QUQ5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Trpc4Q9QUQ5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Trpc4Q9QUQ5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trpc4Q9QUQ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trpc4Q9QUQ5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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