Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trappc2lQ9JME7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trappc2lQ9JME7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms