Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnaja4Q9JMC3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnaja4Q9JMC3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnaja4Q9JMC3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms