Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ybx3Q9JKB3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ybx3Q9JKB3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms