Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smad9Q9JIW5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smad9Q9JIW5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smad9Q9JIW5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms