Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cnpy3Q9DAU1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cnpy3Q9DAU1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cnpy3Q9DAU1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms