Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc54Q9DAL3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc54Q9DAL3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc54Q9DAL3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms