Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Samd8Q9DA37 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms