Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Jam3Q9D8B7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Jam3Q9D8B7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Jam3Q9D8B7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms