Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MsraQ9D6Y7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MsraQ9D6Y7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MsraQ9D6Y7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms