Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc81Q9D5W4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc81Q9D5W4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc81Q9D5W4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms