Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phf6Q9D4J7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf6Q9D4J7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf6Q9D4J7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms