Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39aQ9CYC3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmem39aQ9CYC3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmem39aQ9CYC3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms