Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Malsu1Q9CWV0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Malsu1Q9CWV0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms