Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ska2Q9CR46 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ska2Q9CR46 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ska2Q9CR46 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms