Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sar1bQ9CQC9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sar1bQ9CQC9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms