Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ubl4bQ9CQ84 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ubl4bQ9CQ84 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ubl4bQ9CQ84 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ubl4bQ9CQ84 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ubl4bQ9CQ84 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ubl4bQ9CQ84 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ubl4bQ9CQ84 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ubl4bQ9CQ84 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ubl4bQ9CQ84 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ubl4bQ9CQ84 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ubl4bQ9CQ84 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ubl4bQ9CQ84 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ubl4bQ9CQ84 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ubl4bQ9CQ84 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ubl4bQ9CQ84 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms