Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prpf8Q99PV0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prpf8Q99PV0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prpf8Q99PV0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms