Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bap1Q99PU7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bap1Q99PU7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms