Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Atp1b4Q99ME6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atp1b4Q99ME6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atp1b4Q99ME6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms