Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gdpd3Q99LY2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gdpd3Q99LY2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms