Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab28Q99KL7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rab28Q99KL7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rab28Q99KL7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rab28Q99KL7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rab28Q99KL7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab28Q99KL7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab28Q99KL7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms