Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sf3b3Q921M3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sf3b3Q921M3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b3Q921M3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b3Q921M3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms