Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nup35Q8R4R6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup35Q8R4R6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms