Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SrrdQ8K2M3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.7 ms