Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ep400Q8CHI8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ep400Q8CHI8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ep400Q8CHI8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ep400Q8CHI8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ep400Q8CHI8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ep400Q8CHI8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ep400Q8CHI8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ep400Q8CHI8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ep400Q8CHI8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ep400Q8CHI8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ep400Q8CHI8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms