Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp2Q8CGR7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Upp2Q8CGR7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Upp2Q8CGR7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms