Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc63Q8CDV6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms